Клиническая биохимия
5-hydroxytryptophan
5-hydroxytryptophan — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxytryptophan». Для неё указаны формула C11H12N2O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H12N2O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 12, N — 2, O — 3. Средняя масса составляет 220.228 Да, а моноизотопная масса — 220.08479 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-hydroxytryptophan равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H12N2O3 это приблизительно 2,20228 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C11H12N2O3 — 2-hydroxytryptophan. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 5-hydroxytryptophan
- Класс ChEBI
- hydroxytryptophan
- Формула
- C11H12N2O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 220.228
- Моноизотопная масса, Да
- 220.08479
- InChIKey
- LDCYZAJDBXYCGN-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 114-03-4
- Другие обозначения в ChEBI
- (+-)-5-hydroxytryptophan, 2-amino-3-(5-hydroxy-1H-indol-3-yl)propanoic acid, 2-amino-3-(5-hydroxy-1H-indol-3-yl)propanoic acid, 5-HTP
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28171 · EMBL-EBI · CC BY 4.0