Клиническая микробиология
2-deoxystreptamine
2-deoxystreptamine — антибактериальный агент. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «amino cyclitol». Для неё указаны формула C6H14N2O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
В опытах на бактериях результаты зависят от штамма, плотности инокулюма, среды и времени инкубации. Значение минимальной подавляющей концентрации имеет смысл вместе с условиями измерения. Отнесение молекулы к этой группе само по себе не устанавливает чувствительность клинического изолята.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H14N2O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 14, N — 2, O — 3. Средняя масса составляет 162.189 Да, а моноизотопная масса — 162.10044 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-deoxystreptamine равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H14N2O3 это приблизительно 1,62189 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-deoxystreptamine — сопряжённое основание для «2-deoxystreptamine(1+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-deoxystreptamine
- Класс ChEBI
- amino cyclitol
- Формула
- C6H14N2O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 162.189
- Моноизотопная масса, Да
- 162.10044
- InChIKey
- DTFAJAKTSMLKAT-JDCCYXBGSA-N
- CAS RN
- 2037-48-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (1R,2r,3S,4R,6S)-4,6-diaminocyclohexane-1,2,3-triol, (1R,2r,3S,4R,6S)-4,6-diaminocyclohexane-1,2,3-triol, 2-Desoxystreptamine, 4,6-diamino-1,2,3-cyclohexanetriol
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28295 · EMBL-EBI · CC BY 4.0