Клиническая биохимия
(2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA
(2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «unsaturated fatty acyl-CoA». Для неё указаны формула C33H54N7O17P3S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C33H54N7O17P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 33, H — 54, N — 7, O — 17, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 945.816 Да, а моноизотопная масса — 945.25097 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA равно 10 мкмоль/л, то для формы C33H54N7O17P3S это приблизительно 9,45816 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C33H54N7O17P3S — (3Z,6Z)-dodecadienoyl-CoA. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- (2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-CoA
- Класс ChEBI
- unsaturated fatty acyl-CoA
- Формула
- C33H54N7O17P3S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 945.816
- Моноизотопная масса, Да
- 945.25097
- InChIKey
- BNPQDIKRZDRREL-GQUYLXGASA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2-trans,6-cis)-dodeca-2,6-dienoyl-coenzyme A, (2t,6c)-dodecadienoyl-coenzyme A, (2t,6c)-lauro-2,6-dienoyl-coenzyme A, trans,cis-2,6-laurodienoyl-coenzyme A
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28387 · EMBL-EBI · CC BY 4.0