Клиническая биохимия
3-methyl-2-oxovalerate
3-methyl-2-oxovalerate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «branched-chain keto acid anion». Для неё указаны формула C6H9O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H9O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 9, O — 3. Средняя масса составляет 129.135 Да, а моноизотопная масса — 129.05572 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-methyl-2-oxovalerate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H9O3 это приблизительно 1,29135 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-methyl-2-oxovalerate — сопряжённое основание для «3-methyl-2-oxovaleric acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-methyl-2-oxovalerate
- Класс ChEBI
- branched-chain keto acid anion
- Формула
- C6H9O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 129.135
- Моноизотопная масса, Да
- 129.05572
- InChIKey
- JVQYSWDUAOAHFM-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-keto-3-methylvalerate, 2-Oxo-3-methylpentanoate, 2-Oxo-3-methylvalerate, 3-Methyl-2-oxopentanoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28654 · EMBL-EBI · CC BY 4.0