Клиническая биохимия
serotonin
serotonin — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «monoamine molecular messenger». Для неё указаны формула C10H12N2O и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H12N2O задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 12, N — 2, O — 1. Средняя масса составляет 176.219 Да, а моноизотопная масса — 176.09496 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание serotonin равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H12N2O это приблизительно 1,76219 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: serotonin — сопряжённое основание для «serotonin(1+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- serotonin
- Класс ChEBI
- monoamine molecular messenger
- Формула
- C10H12N2O
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 176.219
- Моноизотопная масса, Да
- 176.09496
- InChIKey
- QZAYGJVTTNCVMB-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 50-67-9
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-(2-Aminoethyl)-1H-indol-5-ol, 3-(2-Aminoethyl)-1H-indol-5-ol, 3-(2-aminoethyl)-1H-indol-5-ol, 3-(2-aminoethyl)-1H-indol-5-ol
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28790 · EMBL-EBI · CC BY 4.0