Клиническая биохимия
2-deoxy-D-ribose
2-deoxy-D-ribose — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «deoxypentose». Для неё указаны формула C5H10O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H10O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 10, O — 4. Средняя масса составляет 134.131 Да, а моноизотопная масса — 134.05791 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-deoxy-D-ribose равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H10O4 это приблизительно 1,34131 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название 2-deoxy-D-ribose и формулу C5H10O4, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- 2-deoxy-D-ribose
- Класс ChEBI
- deoxypentose
- Формула
- C5H10O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 134.131
- Моноизотопная масса, Да
- 134.05791
- InChIKey
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N
- CAS RN
- 533-67-5
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-Deoxy-D-erythro-pentose, 2-deoxy-D-erythro-pentose, 2-deoxy-D-erythro-pentose, aldehydo-2-deoxy-D-ribose
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:28816 · EMBL-EBI · CC BY 4.0