Клиническая микробиология
tyrocidine A
tyrocidine A — антибактериальный агент. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «гомодетные циклические пептиды». Для неё указаны формула C66H87N13O13 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
В опытах на бактериях результаты зависят от штамма, плотности инокулюма, среды и времени инкубации. Значение минимальной подавляющей концентрации имеет смысл вместе с условиями измерения. Отнесение молекулы к этой группе само по себе не устанавливает чувствительность клинического изолята.
Как прочитать формулу и массу
Формула C66H87N13O13 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 66, H — 87, N — 13, O — 13. Средняя масса составляет 1270.5 Да, а моноизотопная масса — 1269.65463 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание tyrocidine A равно 10 мкмоль/л, то для формы C66H87N13O13 это приблизительно 12,705 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «homodetic cyclic peptide» описано другое соединение — lugdunin с формулой C40H62N8O6S. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- tyrocidine A
- Класс ChEBI
- homodetic cyclic peptide
- Формула
- C66H87N13O13
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1270.5
- Моноизотопная масса, Да
- 1269.65463
- InChIKey
- GSXRBRIWJGAPDU-BBVRJQLQSA-N
- CAS RN
- 8011-61-8
- Другие обозначения в ChEBI
- cyclo-(D-Phe-Pro-Phe-D-Phe-Asn-Gln-Tyr-Val-Orn-Leu), cyclo-(D-PheProPhe-D-PheAsnGlnTyrValOrnLeu), TrcA
- Химическая группа
- гомодетные циклические пептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:29701 · EMBL-EBI · CC BY 4.0