Клиническая биохимия
fumarate(2-)
fumarate(2-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «butenedioate». Для неё указаны формула C4H2O4 и формальный заряд -2.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H2O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 2, O — 4. Средняя масса составляет 114.056 Да, а моноизотопная масса — 113.99641 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание fumarate(2-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H2O4 это приблизительно 1,14056 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: fumarate(2-) — сопряжённое основание для «fumarate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- fumarate(2-)
- Класс ChEBI
- butenedioate
- Формула
- C4H2O4
- Формальный заряд
- -2
- Средняя масса, Да
- 114.056
- Моноизотопная масса, Да
- 113.99641
- InChIKey
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-L
- CAS RN
- 142-42-7
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-but-2-enedioate, (2E)-but-2-enedioate, (2E)-but-2-enedioate, (2E)-but-2-enedioate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:29806 · EMBL-EBI · CC BY 4.0