Клиническая биохимия
5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate
5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «myo-inositol pentakisphosphate». Для неё указаны формула C6H19O27P7 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H19O27P7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 19, O — 27, P — 7. Средняя масса составляет 740.009 Да, а моноизотопная масса — 739.8277 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H19O27P7 это приблизительно 7,40009 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate — сопряжённая кислота для «5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate(13-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-diphospho-1D-myo-inositol pentakisphosphate
- Класс ChEBI
- myo-inositol pentakisphosphate
- Формула
- C6H19O27P7
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 740.009
- Моноизотопная масса, Да
- 739.8277
- InChIKey
- UPHPWXPNZIOZJL-KXXVROSKSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 1D-myo-inositol 5-diphosphate 1,2,3,4,6-pentakisphosphate, 1D-myo-Inositol 5-diphosphate pentakisphosphate, 1D-myo-inositol 5-diphosphate pentakisphosphate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:30164 · EMBL-EBI · CC BY 4.0