Клиническая биохимия
galactaric acid
galactaric acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hexaric acid». Для неё указаны формула C6H10O8 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H10O8 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 10, O — 8. Средняя масса составляет 210.138 Да, а моноизотопная масса — 210.03757 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание galactaric acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H10O8 это приблизительно 2,10138 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: galactaric acid — сопряжённая кислота для «galactarate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- galactaric acid
- Класс ChEBI
- hexaric acid
- Формула
- C6H10O8
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 210.138
- Моноизотопная масса, Да
- 210.03757
- InChIKey
- DSLZVSRJTYRBFB-DUHBMQHGSA-N
- CAS RN
- 526-99-8
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R,3S,4R,5S)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexanedioic acid, (2R,3S,4R,5S)-2,3,4,5-tetrahydroxyhexanedioic acid, acido galactarico, acido mucico
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:30852 · EMBL-EBI · CC BY 4.0