Клиническая биохимия
4-pyridoxate
4-pyridoxate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «pyridoxate». Для неё указаны формула C8H8NO4 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H8NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 8, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 182.155 Да, а моноизотопная масса — 182.04588 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 4-pyridoxate равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H8NO4 это приблизительно 1,82155 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 4-pyridoxate — сопряжённое основание для «4-pyridoxic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 4-pyridoxate
- Класс ChEBI
- pyridoxate
- Формула
- C8H8NO4
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 182.155
- Моноизотопная масса, Да
- 182.04588
- InChIKey
- HXACOUQIXZGNBF-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methyl-4-pyridinecarboxylate, 3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methylisonicotinate, 3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methylpyridine-4-carboxylate, 3-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methylpyridine-4-carboxylate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:30959 · EMBL-EBI · CC BY 4.0