Клиническая биохимия
undecanoate
undecanoate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «straight-chain saturated fatty acid anion». Для неё указаны формула C11H21O2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H21O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 21, O — 2. Средняя масса составляет 185.287 Да, а моноизотопная масса — 185.1547 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание undecanoate равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H21O2 это приблизительно 1,85287 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: undecanoate — сопряжённое основание для «undecanoic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- undecanoate
- Класс ChEBI
- straight-chain saturated fatty acid anion
- Формула
- C11H21O2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 185.287
- Моноизотопная масса, Да
- 185.1547
- InChIKey
- ZDPHROOEEOARMN-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 1-decanecarboxylate, CH3-[CH2]9-COO(-), hendecanoate, n-undecanoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:32369 · EMBL-EBI · CC BY 4.0