Клиническая биохимия
arachidonate
arachidonate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «анионы длинноцепочечных жирных кислот». Для неё указаны формула C20H31O2 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H31O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 31, O — 2. Средняя масса составляет 303.466 Да, а моноизотопная масса — 303.23295 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание arachidonate равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H31O2 это приблизительно 3,03466 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: arachidonate — сопряжённое основание для «arachidonic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- arachidonate
- Класс ChEBI
- long-chain fatty acid anion
- Формула
- C20H31O2
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 303.466
- Моноизотопная масса, Да
- 303.23295
- InChIKey
- YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (20:4n6), (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate, (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate, (5Z,8Z,11Z,14Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate
- Химическая группа
- анионы длинноцепочечных жирных кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:32395 · EMBL-EBI · CC BY 4.0