Клиническая биохимия
prostaglandin D3
prostaglandin D3 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandins D». Для неё указаны формула C20H30O5 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H30O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 30, O — 5. Средняя масса составляет 350.455 Да, а моноизотопная масса — 350.20932 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание prostaglandin D3 равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H30O5 это приблизительно 3,50455 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: prostaglandin D3 — сопряжённая кислота для «prostaglandin D3(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- prostaglandin D3
- Класс ChEBI
- prostaglandins D
- Формула
- C20H30O5
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 350.455
- Моноизотопная масса, Да
- 350.20932
- InChIKey
- ANOICLBSJIMQTA-WXGBOJPQSA-N
- CAS RN
- 71902-47-1
- Другие обозначения в ChEBI
- 9S,15S-Dihydroxy-11-oxo-5Z,13E,17Z-prostatrienoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:34939 · EMBL-EBI · CC BY 4.0