Клиническая биохимия
D-pipecolic acid
D-pipecolic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «pipecolic acid». Для неё указаны формула C6H11NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H11NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 11, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 129.159 Да, а моноизотопная масса — 129.07898 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание D-pipecolic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H11NO2 это приблизительно 1,29159 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: D-pipecolic acid — сопряжённая кислота для «D-pipecolate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- D-pipecolic acid
- Класс ChEBI
- pipecolic acid
- Формула
- C6H11NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 129.159
- Моноизотопная масса, Да
- 129.07898
- InChIKey
- HXEACLLIILLPRG-RXMQYKEDSA-N
- CAS RN
- 1723-00-8
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R)-piperidine-2-carboxylic acid, (2R)-piperidine-2-carboxylic acid, (R)-pipecolic acid, (R)-piperidine-2-carboxylic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:41582 · EMBL-EBI · CC BY 4.0