Флуорохромы
oregon green 488
oregon green 488 — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «xanthene dye». Для неё указаны формула C21H10F2O7 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C21H10F2O7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 21, H — 10, F — 2, O — 7. Средняя масса составляет 412.3 Да, а моноизотопная масса — 412.03946 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание oregon green 488 равно 10 мкмоль/л, то для формы C21H10F2O7 это приблизительно 4,123 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название oregon green 488 и формулу C21H10F2O7, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- oregon green 488
- Класс ChEBI
- xanthene dye
- Формула
- C21H10F2O7
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 412.3
- Моноизотопная масса, Да
- 412.03946
- InChIKey
- BRJCLSQFZSHLRL-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- oregon green 488 carboxylate, oregon green 488 carboxylic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:44777 · EMBL-EBI · CC BY 4.0