Клиническая биохимия
13-cis-retinal
13-cis-retinal — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «retinal». Для неё указаны формула C20H28O и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H28O задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 28, O — 1. Средняя масса составляет 284.443 Да, а моноизотопная масса — 284.21402 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 13-cis-retinal равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H28O это приблизительно 2,84443 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C20H28O — all-trans-3,4-didehydroretinol. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 13-cis-retinal
- Класс ChEBI
- retinal
- Формула
- C20H28O
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 284.443
- Моноизотопная масса, Да
- 284.21402
- InChIKey
- NCYCYZXNIZJOKI-HWCYFHEPSA-N
- CAS RN
- 472-86-6
- Другие обозначения в ChEBI
- (13cis)-retinal, 13-cis-retinaldehyde
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:45487 · EMBL-EBI · CC BY 4.0