Клиническая биохимия
3-deoxy-D-arabino-hexonic acid
3-deoxy-D-arabino-hexonic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hexonic acid». Для неё указаны формула C6H12O6 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H12O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 12, O — 6. Средняя масса составляет 180.156 Да, а моноизотопная масса — 180.06339 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-deoxy-D-arabino-hexonic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H12O6 это приблизительно 1,80156 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C6H12O6 — muco-inositol. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 3-deoxy-D-arabino-hexonic acid
- Класс ChEBI
- hexonic acid
- Формула
- C6H12O6
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 180.156
- Моноизотопная масса, Да
- 180.06339
- InChIKey
- YGMNHEPVTNXLLS-VAYJURFESA-N
- CAS RN
- 29625-79-4
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S,4S,5R)-2,4,5,6-tetrahydroxyhexanoic acid, 3-deoxy-arabino-hexonic acid, 3-deoxyarabino-hexonic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:45626 · EMBL-EBI · CC BY 4.0