Клиническая биохимия
D-erythrose 4-phosphate
D-erythrose 4-phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «erythrose phosphate». Для неё указаны формула C4H9O7P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H9O7P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 9, O — 7, P — 1. Средняя масса составляет 200.083 Да, а моноизотопная масса — 200.00859 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание D-erythrose 4-phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H9O7P это приблизительно 2,00083 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: D-erythrose 4-phosphate — сопряжённая кислота для «D-erythrose 4-phosphate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- D-erythrose 4-phosphate
- Класс ChEBI
- erythrose phosphate
- Формула
- C4H9O7P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 200.083
- Моноизотопная масса, Да
- 200.00859
- InChIKey
- NGHMDNPXVRFFGS-IUYQGCFVSA-N
- CAS RN
- 585-18-2
- Другие обозначения в ChEBI
- (2R,3R)-2,3-dihydroxy-4-oxobutyl dihydrogen phosphate, (2R,3R)-2,3-dihydroxy-4-oxobutyl dihydrogen phosphate, 4-O-phosphono-D-erythrose, D-erythrose 4-(dihydrogen phosphate)
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:48153 · EMBL-EBI · CC BY 4.0