Клиническая биохимия
3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid
3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «дигидроксибензойные кислоты». Для неё указаны формула C57H86O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C57H86O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 57, H — 86, O — 4. Средняя масса составляет 835.311 Да, а моноизотопная масса — 834.65261 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C57H86O4 это приблизительно 8,35311 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid — сопряжённая кислота для «3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid
- Класс ChEBI
- dihydroxybenzoic acid
- Формула
- C57H86O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 835.311
- Моноизотопная масса, Да
- 834.65261
- InChIKey
- HGWUGDIATLOPBN-BHZQGFRMSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 3,4-dihydroxy-5-decaprenylbenzoic acid, all-trans-3,4-dihydroxy-5-decaprenylbenzoic acid, all-trans-3-decaprenyl-4,5-dihydroxybenzoic acid
- Химическая группа
- дигидроксибензойные кислоты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:50775 · EMBL-EBI · CC BY 4.0