Флуорохромы
nile red
nile red — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «aromatic amine». Для неё указаны формула C20H18N2O2 и формальный заряд 0. Другие роли, приведённые для той же структуры: гистологический краситель.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H18N2O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 18, N — 2, O — 2. Средняя масса составляет 318.376 Да, а моноизотопная масса — 318.13683 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание nile red равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H18N2O2 это приблизительно 3,18376 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C20H18N2O2 — NK372135A. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- nile red
- Класс ChEBI
- aromatic amine
- Формула
- C20H18N2O2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 318.376
- Моноизотопная масса, Да
- 318.13683
- InChIKey
- VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 7385-67-3
- Другие обозначения в ChEBI
- 9-(diethylamino)-5H-benzo[a]phenoxazin-5-one, 9-(diethylamino)-5H-benzo[a]phenoxazin-5-one
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:52169 · EMBL-EBI · CC BY 4.0