Клиническая биохимия
5-oxo-ETE
5-oxo-ETE — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «oxoicosatetraenoic acid». Для неё указаны формула C20H30O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H30O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 30, O — 3. Средняя масса составляет 318.457 Да, а моноизотопная масса — 318.21949 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-oxo-ETE равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H30O3 это приблизительно 3,18457 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5-oxo-ETE — сопряжённая кислота для «5-oxo-ETE(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5-oxo-ETE
- Класс ChEBI
- oxoicosatetraenoic acid
- Формула
- C20H30O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 318.457
- Моноизотопная масса, Да
- 318.21949
- InChIKey
- MEASLHGILYBXFO-XTDASVJISA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (6E,8Z,11Z,14Z)-5-Oxoicosa-6,8,11,14-tetraenoic acid, (6E,8Z,11Z,14Z)-5-Oxoicosa-6,8,11,14-tetraenoic acid, (6E,8Z,11Z,14Z)-5-oxoicosa-6,8,11,14-tetraenoic acid, (6E,8Z,11Z,14Z)-5-oxoicosa-6,8,11,14-tetraenoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:52449 · EMBL-EBI · CC BY 4.0