Клиническая биохимия
L-galactonate
L-galactonate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «galactonate». Для неё указаны формула C6H11O7 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H11O7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 11, O — 7. Средняя масса составляет 195.147 Да, а моноизотопная масса — 195.05103 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-galactonate равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H11O7 это приблизительно 1,95147 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-galactonate — сопряжённое основание для «L-galactonic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-galactonate
- Класс ChEBI
- galactonate
- Формула
- C6H11O7
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 195.147
- Моноизотопная масса, Да
- 195.05103
- InChIKey
- RGHNJXZEOKUKBD-RSJOWCBRSA-M
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:53071 · EMBL-EBI · CC BY 4.0