Клиническая биохимия
(2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA(4-)
(2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA(4-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «acyl-CoA(4-)». Для неё указаны формула C26H40N7O18P3S и формальный заряд -4.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C26H40N7O18P3S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 26, H — 40, N — 7, O — 18, P — 3, S — 1. Средняя масса составляет 863.626 Да, а моноизотопная масса — 863.13853 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA(4-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C26H40N7O18P3S это приблизительно 8,63626 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA(4-) — сопряжённое основание для «(2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA(4-)
- Класс ChEBI
- acyl-CoA(4-)
- Формула
- C26H40N7O18P3S
- Формальный заряд
- -4
- Средняя масса, Да
- 863.626
- Моноизотопная масса, Да
- 863.13853
- InChIKey
- PEKYNTFSOBAABV-LQUDNSJZSA-J
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA, (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-CoA tetraanion, (2S,3S)-3-hydroxy-2-methylbutanoyl-coenzyme A(4-)
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:57312 · EMBL-EBI · CC BY 4.0