Клиническая биохимия
5(S)-HPETE(1-)
5(S)-HPETE(1-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «HPETE anion». Для неё указаны формула C20H31O4 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H31O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 31, O — 4. Средняя масса составляет 335.464 Да, а моноизотопная масса — 335.22278 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5(S)-HPETE(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H31O4 это приблизительно 3,35464 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 5(S)-HPETE(1-) — сопряжённое основание для «5(S)-HPETE». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 5(S)-HPETE(1-)
- Класс ChEBI
- HPETE anion
- Формула
- C20H31O4
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 335.464
- Моноизотопная масса, Да
- 335.22278
- InChIKey
- JNUUNUQHXIOFDA-JGKLHWIESA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (5S)-hydroperoxy-(6E,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate, (5S,6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosa-6,8,11,14-tetraenoate, (5S,6E,8Z,11Z,14Z)-5-hydroperoxyicosa-6,8,11,14-tetraenoate, 5(S)-HPETE anion
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:57450 · EMBL-EBI · CC BY 4.0