Клиническая биохимия
3-dehydrocarnitine
3-dehydrocarnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «ammonium betaine». Для неё указаны формула C7H13NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H13NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 13, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 159.185 Да, а моноизотопная масса — 159.08954 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-dehydrocarnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H13NO3 это приблизительно 1,59185 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-dehydrocarnitine — сопряжённое основание для «3-dehydrocarnitinium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-dehydrocarnitine
- Класс ChEBI
- ammonium betaine
- Формула
- C7H13NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 159.185
- Моноизотопная масса, Да
- 159.08954
- InChIKey
- YNOWULSFLVIUDH-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-oxo-4-(trimethylammonio)butanoate, 3-oxo-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, 3-oxo-4-(trimethylazaniumyl)butanoate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:57885 · EMBL-EBI · CC BY 4.0