Клиническая биохимия
all-trans-4-hydroxyretinoic acid
all-trans-4-hydroxyretinoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «вторичные аллильные спирты». Для неё указаны формула C20H28O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H28O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 28, O — 3. Средняя масса составляет 316.441 Да, а моноизотопная масса — 316.20384 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание all-trans-4-hydroxyretinoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H28O3 это приблизительно 3,16441 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: all-trans-4-hydroxyretinoic acid — сопряжённая кислота для «all-trans-4-hydroxyretinoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- all-trans-4-hydroxyretinoic acid
- Класс ChEBI
- secondary allylic alcohol
- Формула
- C20H28O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 316.441
- Моноизотопная масса, Да
- 316.20384
- InChIKey
- KGUMXGDKXYTTEY-FRCNGJHJSA-N
- CAS RN
- 66592-72-1
- Другие обозначения в ChEBI
- (7E,9E,11E,13E)-4-hydroxyretinoic acid, 4-hydroxy-(7E,9E,11E,13E)-retinoic acid, 4-hydroxy-all-trans-retinoic acid, 4-hydroxyretinoic acid
- Химическая группа
- вторичные аллильные спирты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:63795 · EMBL-EBI · CC BY 4.0