Клиническая биохимия
2-hydroxy-3-methylbutyrate
2-hydroxy-3-methylbutyrate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «анионы гидроксимонокарбоновых кислот». Для неё указаны формула C5H9O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H9O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 9, O — 3. Средняя масса составляет 117.124 Да, а моноизотопная масса — 117.05572 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-hydroxy-3-methylbutyrate равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H9O3 это приблизительно 1,17124 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-hydroxy-3-methylbutyrate — сопряжённое основание для «2-hydroxy-3-methylbutyric acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-hydroxy-3-methylbutyrate
- Класс ChEBI
- hydroxy monocarboxylic acid anion
- Формула
- C5H9O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 117.124
- Моноизотопная масса, Да
- 117.05572
- InChIKey
- NGEWQZIDQIYUNV-UHFFFAOYSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 2-hydroxy-3-methylbutanoate, 2-hydroxy-3-methylbutanoate, 2-Hydroxyisopentanoate, 2-Hydroxyisovalerate
- Химическая группа
- анионы гидроксимонокарбоновых кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:64669 · EMBL-EBI · CC BY 4.0