Клиническая микробиология
tyrocidine B
tyrocidine B — антибактериальный агент. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «гомодетные циклические пептиды». Для неё указаны формула C68H88N14O13 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
В опытах на бактериях результаты зависят от штамма, плотности инокулюма, среды и времени инкубации. Значение минимальной подавляющей концентрации имеет смысл вместе с условиями измерения. Отнесение молекулы к этой группе само по себе не устанавливает чувствительность клинического изолята.
Как прочитать формулу и массу
Формула C68H88N14O13 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 68, H — 88, N — 14, O — 13. Средняя масса составляет 1309.537 Да, а моноизотопная масса — 1308.66553 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание tyrocidine B равно 10 мкмоль/л, то для формы C68H88N14O13 это приблизительно 13,09537 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «homodetic cyclic peptide» описано другое соединение — lugdunin с формулой C40H62N8O6S. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- tyrocidine B
- Класс ChEBI
- homodetic cyclic peptide
- Формула
- C68H88N14O13
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1309.537
- Моноизотопная масса, Да
- 1308.66553
- InChIKey
- PUVWPDQSNYAMEH-UQHIYWQBSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- cyclo-(D-Phe-Pro-Trp-D-Phe-Asn-Gln-Tyr-Val-Orn-Leu)
- Химическая группа
- гомодетные циклические пептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:71948 · EMBL-EBI · CC BY 4.0