Клиническая биохимия
9-HODE
9-HODE — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «octadecadienoic acid». Для неё указаны формула C18H32O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C18H32O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 18, H — 32, O — 3. Средняя масса составляет 296.451 Да, а моноизотопная масса — 296.23514 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 9-HODE равно 10 мкмоль/л, то для формы C18H32O3 это приблизительно 2,96451 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 9-HODE — сопряжённая кислота для «9-HODE(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 9-HODE
- Класс ChEBI
- octadecadienoic acid
- Формула
- C18H32O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 296.451
- Моноизотопная масса, Да
- 296.23514
- InChIKey
- NPDSHTNEKLQQIJ-ZJHFMPGASA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (10E,12Z)-9-HODE, (10E,12Z)-9-hydroxyoctadeca-10,12-dienoic acid, (10E,12Z)-9-hydroxyoctadeca-10,12-dienoic acid, 9-hydroxy-10E,12Z-octadecadienoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:72651 · EMBL-EBI · CC BY 4.0