Клиническая биохимия
O-isovalerylcarnitine
O-isovalerylcarnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «C5-acylcarnitine». Для неё указаны формула C12H23NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C12H23NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 12, H — 23, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 245.319 Да, а моноизотопная масса — 245.16271 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-isovalerylcarnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C12H23NO4 это приблизительно 2,45319 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C12H23NO4 — 2-methylbutyrylcarnitine. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- O-isovalerylcarnitine
- Класс ChEBI
- C5-acylcarnitine
- Формула
- C12H23NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 245.319
- Моноизотопная масса, Да
- 245.16271
- InChIKey
- IGQBPDJNUXPEMT-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-[(3-methylbutanoyl)oxy]-4-(trimethylammonio)butanoate, 3-[(3-methylbutanoyl)oxy]-4-(trimethylammonio)butanoate, 3-methylbutyrylcarnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:73025 · EMBL-EBI · CC BY 4.0