Клиническая биохимия
O-dodecanoylcarnitine
O-dodecanoylcarnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «O-ацилкарнитины». Для неё указаны формула C19H37NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C19H37NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 19, H — 37, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 343.508 Да, а моноизотопная масса — 343.27226 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-dodecanoylcarnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C19H37NO4 это приблизительно 3,43508 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «O-acylcarnitine» описано другое соединение — O-heptadecanoylcarnitine с формулой C24H47NO4. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- O-dodecanoylcarnitine
- Класс ChEBI
- O-acylcarnitine
- Формула
- C19H37NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 343.508
- Моноизотопная масса, Да
- 343.27226
- InChIKey
- FUJLYHJROOYKRA-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 3-(dodecanoyloxy)-4-(trimethylammonio)butanoate, 3-(dodecanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, 3-(dodecanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, dodecanoylcarnitine
- Химическая группа
- O-ацилкарнитины
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:73054 · EMBL-EBI · CC BY 4.0