Клиническая биохимия
Pro-Hyp
Pro-Hyp — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «дипептиды». Для неё указаны формула C10H16N2O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H16N2O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 16, N — 2, O — 4. Средняя масса составляет 228.248 Да, а моноизотопная масса — 228.11101 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание Pro-Hyp равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H16N2O4 это приблизительно 2,28248 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: Pro-Hyp — таутомер соединения «Pro-Hyp zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- Pro-Hyp
- Класс ChEBI
- dipeptide
- Формула
- C10H16N2O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 228.248
- Моноизотопная масса, Да
- 228.11101
- InChIKey
- ONPXCLZMBSJLSP-CSMHCCOUSA-N
- CAS RN
- 18684-24-7
- Другие обозначения в ChEBI
- L-Pro-L-Hyp, L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-L-proline, L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-L-proline, L-Prolyl-L-hydroxyproline
- Химическая группа
- дипептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:74767 · EMBL-EBI · CC BY 4.0