Клиническая биохимия
2-aminooctanoic acid
2-aminooctanoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «alpha-amino fatty acid». Для неё указаны формула C8H17NO2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H17NO2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 17, N — 1, O — 2. Средняя масса составляет 159.229 Да, а моноизотопная масса — 159.12593 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 2-aminooctanoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H17NO2 это приблизительно 1,59229 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 2-aminooctanoic acid — сопряжённое основание для «1-carboxyheptan-1-aminium». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 2-aminooctanoic acid
- Класс ChEBI
- alpha-amino fatty acid
- Формула
- C8H17NO2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 159.229
- Моноизотопная масса, Да
- 159.12593
- InChIKey
- AKVBCGQVQXPRLD-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 644-90-6
- Другие обозначения в ChEBI
- (+-)-2-aminooctanoic acid, (+/-)-2-aminooctanoic acid, 2-amino-DL-caprylic acid, 2-aminocaprylic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:75145 · EMBL-EBI · CC BY 4.0