Клиническая биохимия
(2S)-2-(4-\{[(1R,2S)-2-hydroxycyclopentyl]methyl\}phenyl)propanoic acid
(2S)-2-(4-\{[(1R,2S)-2-hydroxycyclopentyl]methyl\}phenyl)propanoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «cyclopentanols». Для неё указаны формула C15H20O3 и формальный заряд 0. Другие роли, приведённые для той же структуры: метаболит лекарственного вещества.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C15H20O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 15, H — 20, O — 3. Средняя масса составляет 248.322 Да, а моноизотопная масса — 248.14124 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (2S)-2-(4-\{[(1R,2S)-2-hydroxycyclopentyl]methyl\}phenyl)propanoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C15H20O3 это приблизительно 2,48322 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C15H20O3 — inuloxin A. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- (2S)-2-(4-\{[(1R,2S)-2-hydroxycyclopentyl]methyl\}phenyl)propanoic acid
- Класс ChEBI
- cyclopentanols
- Формула
- C15H20O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 248.322
- Моноизотопная масса, Да
- 248.14124
- InChIKey
- SHAHPWSYJFYMRX-GDLCADMTSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- loxoprofen active metabolite, Loxoprofen trans alcohol, loxoprofen trans alcohol, loxoprofen-SRS
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:76204 · EMBL-EBI · CC BY 4.0