Клиническая биохимия
5-(hydroxymethyl)cytosine
5-(hydroxymethyl)cytosine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «aromatic primary alcohol». Для неё указаны формула C5H7N3O2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H7N3O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 7, N — 3, O — 2. Средняя масса составляет 141.13 Да, а моноизотопная масса — 141.05383 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-(hydroxymethyl)cytosine равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H7N3O2 это приблизительно 1,4113 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «aromatic primary alcohol» описано другое соединение — 12-hydroxynevirapine с формулой C15H14N4O2. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- 5-(hydroxymethyl)cytosine
- Класс ChEBI
- aromatic primary alcohol
- Формула
- C5H7N3O2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 141.13
- Моноизотопная масса, Да
- 141.05383
- InChIKey
- RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 1123-95-1
- Другие обозначения в ChEBI
- 4-Amino-5-(hydroxymethyl)-2(1H)-pyrimidinone, 4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2(1H)-one, 4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2(1H)-one, 5-hydroxymethylcytosine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:76792 · EMBL-EBI · CC BY 4.0