Клиническая биохимия
apelin-13
apelin-13 — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «олигопептиды». Для неё указаны формула C69H111N23O16S и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C69H111N23O16S задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 69, H — 111, N — 23, O — 16, S — 1. Средняя масса составляет 1550.859 Да, а моноизотопная масса — 1549.82999 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание apelin-13 равно 10 мкмоль/л, то для формы C69H111N23O16S это приблизительно 15,50859 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: apelin-13 — сопряжённое основание для «apelin-13(3+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- apelin-13
- Класс ChEBI
- oligopeptide
- Формула
- C69H111N23O16S
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1550.859
- Моноизотопная масса, Да
- 1549.82999
- InChIKey
- XXCCRHIAIBQDPX-PEWBXTNBSA-N
- CAS RN
- 217082-58-1
- Другие обозначения в ChEBI
- apelin 13, apelin-13 peptide, Gln-Arg-Pro-Arg-Leu-Ser-His-Lys-Gly-Pro-Met-Pro-Phe
- Химическая группа
- олигопептиды
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:80131 · EMBL-EBI · CC BY 4.0