Клиническая биохимия
indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid
indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «indoledione». Для неё указаны формула C9H5NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C9H5NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 9, H — 5, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 191.142 Да, а моноизотопная масса — 191.02186 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C9H5NO4 это приблизительно 1,91142 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid — сопряжённая кислота для «indole-5,6-quinone-2-carboxylate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid
- Класс ChEBI
- indoledione
- Формула
- C9H5NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 191.142
- Моноизотопная масса, Да
- 191.02186
- InChIKey
- FXURFKFOPCZEKG-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 161940-76-7
- Другие обозначения в ChEBI
- 5,6-bis(oxidanylidene)-1H-indole-2-carboxylic acid, 5,6-diketo-1H-indole-2-carboxylic acid, 5,6-dioxo-1H-indole-2-carboxylic acid, 5,6-dioxo-5,6-dihydro-1H-indole-2-carboxylic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:81394 · EMBL-EBI · CC BY 4.0