Флуорохромы
BODIPY-3823
BODIPY-3823 — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «монокарбоновые кислоты». Для неё указаны формула C22H31BF2N2O2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C22H31BF2N2O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 22, H — 31, B — 1, F — 2, N — 2, O — 2. Средняя масса составляет 404.31 Да, а моноизотопная масса — 404.24467 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание BODIPY-3823 равно 10 мкмоль/л, то для формы C22H31BF2N2O2 это приблизительно 4,0431 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «monocarboxylic acid» описано другое соединение — piperonylic acid с формулой C8H6O4. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- BODIPY-3823
- Класс ChEBI
- monocarboxylic acid
- Формула
- C22H31BF2N2O2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 404.31
- Моноизотопная масса, Да
- 404.24467
- InChIKey
- RHFBACKVNHUYNJ-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- C1-BODIPY 500/510 C12
- Химическая группа
- монокарбоновые кислоты
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:82650 · EMBL-EBI · CC BY 4.0