Клиническая биохимия
all-trans-dodecaprenyl diphosphate
all-trans-dodecaprenyl diphosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «all-trans-polyprenyl diphosphate». Для неё указаны формула C60H100O7P2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C60H100O7P2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 60, H — 100, O — 7, P — 2. Средняя масса составляет 995.401 Да, а моноизотопная масса — 994.69443 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание all-trans-dodecaprenyl diphosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C60H100O7P2 это приблизительно 9,95401 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: all-trans-dodecaprenyl diphosphate — сопряжённая кислота для «all-trans-dodecaprenyl diphosphate(3-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- all-trans-dodecaprenyl diphosphate
- Класс ChEBI
- all-trans-polyprenyl diphosphate
- Формула
- C60H100O7P2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 995.401
- Моноизотопная масса, Да
- 994.69443
- InChIKey
- WURMRKUXTPWSRM-GNZYJLLNSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- all-trans-dodecaprenyl pyrophosphate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:84599 · EMBL-EBI · CC BY 4.0