Клиническая биохимия
11-epi-prostaglandin F2alpha(1-)
11-epi-prostaglandin F2alpha(1-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «prostaglandin carboxylic acid anion». Для неё указаны формула C20H33O5 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H33O5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 33, O — 5. Средняя масса составляет 353.479 Да, а моноизотопная масса — 353.23335 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 11-epi-prostaglandin F2alpha(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H33O5 это приблизительно 3,53479 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 11-epi-prostaglandin F2alpha(1-) — сопряжённое основание для «11-epi-prostaglandin F2alpha». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 11-epi-prostaglandin F2alpha(1-)
- Класс ChEBI
- prostaglandin carboxylic acid anion
- Формула
- C20H33O5
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 353.479
- Моноизотопная масса, Да
- 353.23335
- InChIKey
- PXGPLTODNUVGFL-ZWAKLXPCSA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- 11beta-PGF2, 11beta-prostaglandin F2, 9alpha,11beta-prostaglandin F2
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:85173 · EMBL-EBI · CC BY 4.0