Клиническая биохимия
CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol
CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «CDP-diacylglycerol». Для неё указаны формула C48H87N3O15P2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C48H87N3O15P2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 48, H — 87, N — 3, O — 15, P — 2. Средняя масса составляет 1008.178 Да, а моноизотопная масса — 1007.56124 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol равно 10 мкмоль/л, то для формы C48H87N3O15P2 это приблизительно 10,08178 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol — сопряжённая кислота для «CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- CDP-1-stearoyl-2-oleoyl-sn-glycerol
- Класс ChEBI
- CDP-diacylglycerol
- Формула
- C48H87N3O15P2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 1008.178
- Моноизотопная масса, Да
- 1007.56124
- InChIKey
- BZFPCBWCAKHOFP-ABELOIHJSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 1-Octadecanoyl-2-(9Z-octadecenoyl)-sn-glycero-3-CDP, 1-Stearoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-cytidine-5'-diphosphate, CDP-DG(18:0/18:1(9Z))
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:85841 · EMBL-EBI · CC BY 4.0