Клиническая биохимия
3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylate
3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «steroid acid anion». Для неё указаны формула C28H45O3 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C28H45O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 28, H — 45, O — 3. Средняя масса составляет 429.665 Да, а моноизотопная масса — 429.33742 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylate равно 10 мкмоль/л, то для формы C28H45O3 это приблизительно 4,29665 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylate — сопряжённое основание для «3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3beta-hydroxy-5alpha-cholest-8-ene-4alpha-carboxylate
- Класс ChEBI
- steroid acid anion
- Формула
- C28H45O3
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 429.665
- Моноизотопная масса, Да
- 429.33742
- InChIKey
- RODBXVVNKJCWQR-GSQAGGHASA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (3beta,4alpha,5alpha)-3-hydroxycholest-8-ene-4-carboxylate, (3beta,4alpha,5alpha)-3-hydroxycholest-8-ene-4-carboxylate, 4-alpha-carboxy-5-alpha-cholest-8-ene-3-beta-ol, 4alpha-carboxy-5alpha-cholest-8-en-3beta-ol(1-)
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:87055 · EMBL-EBI · CC BY 4.0