Клиническая биохимия
cis-3-hydroxy-D-proline
cis-3-hydroxy-D-proline — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «3-hydroxyproline». Для неё указаны формула C5H9NO3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H9NO3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 9, N — 1, O — 3. Средняя масса составляет 131.131 Да, а моноизотопная масса — 131.05824 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание cis-3-hydroxy-D-proline равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H9NO3 это приблизительно 1,31131 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: cis-3-hydroxy-D-proline — таутомер соединения «cis-3-hydroxy-D-proline zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- cis-3-hydroxy-D-proline
- Класс ChEBI
- 3-hydroxyproline
- Формула
- C5H9NO3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 131.131
- Моноизотопная масса, Да
- 131.05824
- InChIKey
- BJBUEDPLEOHJGE-IUYQGCFVSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (+)-cis-(2R,3S)-3-hydroxyproline, (3S)-3-hydroxy-D-proline, (3S)-3-hydroxy-D-proline
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:88157 · EMBL-EBI · CC BY 4.0