Биотрансформация веществ
5(S)-HETrE
5(S)-HETrE — метаболит ксенобиотика у человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «5-HETrE». Для неё указаны формула C20H34O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Ксенобиотик поступает в организм извне, а при биотрансформации могут возникать несколько продуктов. Обнаружение одного продукта оценивают с учётом материала, метода идентификации и времени отбора. Для установления исходного вещества нужна документированная связь между структурами.
Как прочитать формулу и массу
Формула C20H34O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 20, H — 34, O — 3. Средняя масса составляет 322.489 Да, а моноизотопная масса — 322.25079 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5(S)-HETrE равно 10 мкмоль/л, то для формы C20H34O3 это приблизительно 3,22489 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C20H34O3 — 19-HETrE. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 5(S)-HETrE
- Класс ChEBI
- 5-HETrE
- Формула
- C20H34O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 322.489
- Моноизотопная масса, Да
- 322.25079
- InChIKey
- LSADDRSUZRRBAN-FDSUASFTSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (5S,6E,8Z,11Z)-5-hydroxyeicosatrienoic acid, (5S,6E,8Z,11Z)-5-hydroxyicosa-6,8,11-trienoic acid, (5S,6E,8Z,11Z)-5-hydroxyicosa-6,8,11-trienoic acid, (5S,6E,8Z,11Z)-5-hydroxyicosatrienoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:88359 · EMBL-EBI · CC BY 4.0