Клиническая биохимия
methylcyclopentane
methylcyclopentane — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «летучие органические соединения». Для неё указаны формула C6H12 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H12 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 12. Средняя масса составляет 84.162 Да, а моноизотопная масса — 84.0939 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание methylcyclopentane равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H12 это приблизительно 0,84162 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C6H12 — 2-methyl-1-pentene. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- methylcyclopentane
- Класс ChEBI
- volatile organic compound
- Формула
- C6H12
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 84.162
- Моноизотопная масса, Да
- 84.0939
- InChIKey
- GDOPTJXRTPNYNR-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 96-37-7
- Другие обозначения в ChEBI
- methyl cyclopentane, methyl-cyclopentane, methylpentamethylene
- Химическая группа
- летучие органические соединения
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:88429 · EMBL-EBI · CC BY 4.0