Клиническая биохимия
N-acetylcadaverine
N-acetylcadaverine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «вторичные амиды карбоновых кислот». Для неё указаны формула C7H16N2O и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H16N2O задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 16, N — 2, O — 1. Средняя масса составляет 144.218 Да, а моноизотопная масса — 144.12626 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание N-acetylcadaverine равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H16N2O это приблизительно 1,44218 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: N-acetylcadaverine — сопряжённое основание для «N-acetylcadaverine(1+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- N-acetylcadaverine
- Класс ChEBI
- secondary carboxamide
- Формула
- C7H16N2O
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 144.218
- Моноизотопная масса, Да
- 144.12626
- InChIKey
- RMOIHHAKNOFHOE-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 32343-73-0
- Другие обозначения в ChEBI
- Monoacetyl cadaverine, monoacetylcadaverine, N-(5-aminopentyl)acetamide, N-(5-aminopentyl)acetamide
- Химическая группа
- вторичные амиды карбоновых кислот
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:88824 · EMBL-EBI · CC BY 4.0