Клиническая биохимия
5-hydroxyindole
5-hydroxyindole — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «hydroxyindoles». Для неё указаны формула C8H7NO и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C8H7NO задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 8, H — 7, N — 1, O — 1. Средняя масса составляет 133.15 Да, а моноизотопная масса — 133.05276 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 5-hydroxyindole равно 10 мкмоль/л, то для формы C8H7NO это приблизительно 1,3315 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C8H7NO — 2-methylbenzoxazole. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- 5-hydroxyindole
- Класс ChEBI
- hydroxyindoles
- Формула
- C8H7NO
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 133.15
- Моноизотопная масса, Да
- 133.05276
- InChIKey
- LMIQERWZRIFWNZ-UHFFFAOYSA-N
- CAS RN
- 1953-54-4
- Другие обозначения в ChEBI
- 1H-indol-5-ol, 1H-indol-5-ol, 5-hydroxy-1H-indole, indol-5-ol
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:89649 · EMBL-EBI · CC BY 4.0