Клиническая биохимия
(11Z)-octadecenoylcarnitine
(11Z)-octadecenoylcarnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «O-octadecenoylcarnitine». Для неё указаны формула C25H47NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C25H47NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 25, H — 47, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 425.654 Да, а моноизотопная масса — 425.35051 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (11Z)-octadecenoylcarnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C25H47NO4 это приблизительно 4,25654 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C25H47NO4 — O-[(11E)-octadecenoyl]-D-carnitine. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- (11Z)-octadecenoylcarnitine
- Класс ChEBI
- O-octadecenoylcarnitine
- Формула
- C25H47NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 425.654
- Моноизотопная масса, Да
- 425.35051
- InChIKey
- HOAMADDCQBUDDY-KHPPLWFESA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (11Z)-octadecenylcarnitine, (Z)-vaccenyl carnitine, 11(Z)-octadecenoylcarnitine, 11(Z)-octadecenylcarnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:89742 · EMBL-EBI · CC BY 4.0