Клиническая биохимия
geranyl phosphate
geranyl phosphate — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «polyprenol phosphate». Для неё указаны формула C10H19O4P и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H19O4P задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 19, O — 4, P — 1. Средняя масса составляет 234.232 Да, а моноизотопная масса — 234.1021 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание geranyl phosphate равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H19O4P это приблизительно 2,34232 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: geranyl phosphate — сопряжённая кислота для «geranyl phosphate(2-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- geranyl phosphate
- Класс ChEBI
- polyprenol phosphate
- Формула
- C10H19O4P
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 234.232
- Моноизотопная масса, Да
- 234.1021
- InChIKey
- FFOWJDCTFSWUMJ-JXMROGBWSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (2E)-3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-yl dihydrogen phosphate, (2E)-3,7-dimethylocta-2,6-dien-1-yl dihydrogen phosphate, geranyl monophosphate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:90159 · EMBL-EBI · CC BY 4.0